Gene Annotation: Case 1  

    At the Edr region in mouse and human two different polypeptides are synthesized

    from overlapping parts of a continuous DNA sequence due to translational recoding

    as a result of programmed -1 ribosomal slippage (ribosomal frameshift). In this

    case, one section of the unique mRNA transcript from this region (pictured below)

    corresponds to the amino acid sequence of one polypeptide, whilst an overlapping

    sequence corresponds, in a different reading frame, to the amino acid sequence of

    a second polypeptide. This is, of course, a common phenomenon in RNA viruses and

    retrotransposons, but here we see a similar mechanism operating in eukaryote genomes.

    

    a. Would you describe this case as one in which one or more than one gene is

    involved in generating the final transcript/s and/or the polypeptide/s that result

    from the process described?

        Probably only one gene

        Unclear

        Probably more than one gene

        Clearly more than one gene

        Skip Item

      

    b. How appropriate are the following descriptions of this case? (If alphabetic letters

    are used to mark a RNA segment, we are referring to the corresponding DNA sequence.)

        b.1.  One gene: A to C

                                                       

        b.2.  Two genes: A + B and B + C

                                                       

        b.3.  Other:  

    c. Are there any other specific names you would use for any of the regions of the

    sequence in this case?

    

    d. If the case description does not provide you with the information you need to

    reply, please indicate what else you would need to know.

    

  Glossary